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宏基因組測序服務(微生物多樣性研究)

更新時間:2023-05-04

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簡要描述:
宏基因組測序服務(微生物多樣性研究)
宏基因組測序,能夠快速準確的得到大量生物數據和豐富的微生物信息,是研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。

 

 

宏基因組測序服務(微生物多樣性研究)

 

微生物群體幾乎存在于世界的每一個生態群落之中,且扮演著重要的的角色。傳統的微生物培養及鑒定方法,極大地限制了微生物多樣性資源的研究及開發利用。宏基因組測序,能夠快速準確的得到大量生物數據和豐富的微生物信息,是研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。

 

技術原理

2005 年,加州大學伯克利分校的 Kevin Chen 和Lior Pachter 將宏基因組定文為“應用現代基因組學的技木直接研究自然狀態下的微生物的有機群落,而不需要在實驗室中分離單一的菌株”的科學。宏基因組測序是以特定生境中的整個微生物群落作為研究對象,提取環境樣本總 DNA,獲得環境微生物基因信息總和,研究環境微生物的群落結構、物種分類、基因功能及代謝網絡等,具有通量高、速度快、信息全等特點,在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優勢。

 

樣本類型

土壤、水體、污泥、腸道物、糞便、皮膚、食品發酵液等。

 

技術路線

  • 樣品準備

  • DNA提取

  • DNA檢測

  • 文庫制備

  • 文庫質檢

  • 上機測序

  • 生信分析

 

技術優點

  • 應用廣

  • 通量高

  • 速度快

  • 數據全(不僅可以鑒定微生物群落,還可以挖掘功能基因及其代謝途徑)


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